Хуки в WP (действия и фильтры), это как нервная система человека. Если вы хотите управлять сайтом на WP и менять его поведение, то в первую очередь вы обязаны изучить систему хуков.

Вот отличная статья на эту тему http://wpmag.ru/2014/wordpress-actions-filters/

Попытка менять сайт напрямую через изменение полотна кода php, это во первых мовитон, а во вторых делает сайт хрупким.